• Molecular & Cellular Toxicology
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• 제4권1호
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• pp.11-15
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• 2008

The expression of neuronal nitric oxide synthase (nNOS) is regulated by various spliced first exons (exon 1a-1i), sharing differentially common exon 2 in diverse human tissues. The highly complex structure and regulation of human nNOS gene gave limitations of information for the precise mechanism of nNOS regulation. In the present study, we report that the repeats of polymorphic dinucleotides $(GT)^nA(TG)^n$ repeats located in just upstream to the exon 1f in human nNOS gene play suppressive role in transcription, as shown in the characteristics of Z-DNA motif in other genes. In neuronal and trophoblast cells transfected transiently with luciferase construct without dinucleotide repeats at the 5'-flanking region of exon 1f in nNOS gene, the luciferase activity was increased markedly. However, the presence of the dinucleotide repeats dramatically suppressed the luciferase activity to the basal level, and which was dependent on the length of $(GT)^n$ and $(TG)^n$ repeats. More importantly, we found the polymorphisms in the length of dinucleotide repeats in human. Furthermore, we show for the first time here that there is a significant association of the lengths of polymorphic dinucleotide $(GT)^n$ and $(TG)^n$ repeats with the risk of schizophrenia.

• The Korean Journal of Physiology and Pharmacology
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• 제3권5호
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• pp.501-505
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• 1999

Tryptophan hydroxylase (TPH), the rate-limiting enzyme in serotonin biosynthesis, is primarily expressed in serotonergic neurons of the raphe nuclei. Simple tandem repeat polymorphisms, typically one to four nucleotides long, are tandemly repeated several times and often characterized by many alleles. To identify the presence of polymorphic repeats, we sequenced the 5'-upstream region of the mouse TPH gene. For the detection of any allelic variants, polymerase chain reaction, nonisotopic single-strand conformation polymophism, and DNA sequencing analyses of the tandem repeat sequences were performed using genomic DNA extracted from 60 ICR mice. Two dinucleotide repeats, $5'-(AC/TG)_{22}-3'$ and $5'-(GT/CA)_{17}3',$ were identified at approximately - 5.7 kb and - 3.4 kb upstream from the transcriptional initiation site of the mouse TPH gene, respectively. Minor allelic variants, $5'-(AC/TG)_{21}-3'$ and $5'-(GT/CA)_{18}-3',$ were observed in heterozygous pairs from 3 of 60 and 1 of 60 ICR mice, respectively. The identification of these microsatellites in the mouse TPH promoter raises the possibility that identical and/or other polymorphic sequences might exist in the upstream region of the human TPH gene.

• 식물조직배양학회지
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• 제24권2호
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• pp.113-117
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• 1997

Simple sequence repeats (SSR)는 진핵생물체에 널리 산재되어 있으며, 큰 다형현상을 나타내고, polymerase chain reaction (PCR)으로 쉽게 분석된다. 이 연구의 목적은 서로 다른 Chlamydomonas reinhardtii계통간의 다형현상과 Chlamydomonas의 SSR 좌위에서의 유전양상을 결정하는데 있었다. C. reinhardtii의 genomic DNA library를 만들어 $^{32}$P로 라벨링한 (AC)$_{11}$ probe를 이용하여 (CA/GT)n 반복서열을 가지는 clone을 선택하기위해 screen하였다. 선택된 clone을 sequencing하여 (CA/GT)n sequence에 인접한 PCR primer set를 제조하였다. PCR은 여러 C. reinhardtii 계통의 SSR 좌위를 증폭하기 위하여 사용하였다. 그 좌위는 및몇 C. reinhardtii 계통에서 다형현상을 보였다. 그러나 그 좌위에서 C. reinhardtii의 6계통중 4계통만 DNA가 PCR 증폭을 하였고 2계통은 증폭을 하지 않았다. C. reinhardtii와 C. smithii의 교배로 생긴 4배체에서 2:2의 분리비를 보여주었는데, 이는 단순한 멘델의 유전양상을 나타낸다. 이러한 결과로 미루어 SSR 다형현상은 Chlamydomonas의 개체 식별, 개체군 연구, 연쇄 분석, 그리고 유전자 지도 작성을 하는데 유용할 것이다.다.

• 한국동물학회:학술대회논문집
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• 한국동물학회 2000년도 한국생물과학협회 학술발표대회
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• pp.263.1-263
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• 2000

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• Tuberculosis and Respiratory Diseases
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• 제58권4호
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• pp.367-374
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• 2005

연구배경 : 장기간 흡연을 하는 사람의 10-20%에서만 COPD가 발생한다는 사실은 COPD의 발생에 유전적 인자가 관여함을 시사한다. 최근 surfactant protein A가, COPD의 병인에 중요한 역할을 하는 것으로 알려진 MMP-9의 분비를 TLR2를 통해 증가시킨다고. 그러므로 COPD의 병인에 TLR2이 역할을 할 수 있을 것이라는 가정 아래, TLR2 유전자의 intron II에 존재하는 Guanine-Thymine (GT)의 반복으로 이루어진 유전자다형성과 한국인에서의 COPD의 발생과의 연관성을 규명하고자 하였다. 방 법 : 흡연력이 있는 남자 COPD 환자와 정상 폐기능을 보이는 남자 흡연자를 대상으로 하여, TLR2 유전자의 intron II의 GT 반복횟수를 확인하였다. 그 GT 반복이 3상성의 분포를 보여 이들을 다시 세 개의 맞섬 유전자 아형으로 분류하여 분석하였다. (12-16회 GT 반복: 짧은 아형; 17-22회 반복: 중간 아형; 23-27회 반복: 긴 아형) 결 과 : 각각의 맞섬유전자 아형의 분포는 125명의 COPD군과 144명의 대조군 사이에 유의한 차이는 없었다(P=0.75). 또한 각각의 맞섬유전자 아형의 유무에 따른 유전형의 빈도도 두 군간의 차이는 관찰할 수 없었다. 결 론 : TLR2 유전자의 intron II에 존재하는 GT 반복으로 이루어진 유전자다형성은 한국인에서 COPD의 발생과 연관되어 있지 않다.