• 한국도서관정보학회지
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• 제36권3호
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• pp.109-136
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• 2005

이 논문에서는 데이터를 효율적으로 공유하기 위해서 제정된 ISO/IEC 11179 메타데이터 레지스트리(Metadata Registry, 이하 MDR) 표준에 관한 내용을 먼저 기술하고, 이 표준에 근거한 시스템간의 데이터 공유의 폭을 넓히기 위해서 W3C에서 개발한 시맨틱웹의 핵심기술과 웹온톨로지 언어(RDF/OWL)를 소개하고 마지막으로 기존의 인간가독형 MDR을 기계가독형으로 구축하기 위한 기본설계 초안을 RDF/OWL 기반으로 작성하였다. 앞으로 이러한MDR이 구축되어 널리 활용된다면 다양한 형태의 고급 정보서비스가 가능할 것으로 판단된다. 메타데이터 요소 정의, 온톨로지의 개념 및 메타데이터 스키마 정의가 기계가독형으로 통합된다면 이용자에게 더욱 정교한 맞춤서비스를 제공할 수 있을 것으로 기대된다. 미래의 과제는 시맨틱 기반MDR의 유용성에 대해서 실험연구를 통한 객관적 평가를 수행하는 것이다.

• The Korean Journal of Physiology and Pharmacology
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• 제24권3호
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• pp.267-276
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• 2020

T In the present study, we investigated the effect of oncogenic H-Ras on rat mdr1b expression in NIH3T3 cells. The constitutive expression of H-Ras^V12 was found to downregulate the mdr1b promoter activity and mdr1b mRNA expression. The doxorubicin-induced mdr1b promoter activity of the H-Ras^V12 expressing NIH3T3 cells was markedly lower than that of control NIH3T3 cells. Additionally, there is a positive correlation between the level of H-Ras^V12 expression and a sensitivity to doxorubicin toxicity. To examine the detailed mechanism of H-Ras^V12-mediated down-regulation of mdr1b expression, antioxidant N-acetylcysteine (NAC) and NADPH oxidase inhibitor diphenylene iodonium (DPI) were used. Pretreating cells with either NAC or DPI significantly enhanced the oncogenic H-Ras-mediated down-regulation of mdr1b expression and markedly prevented doxorubicin-induced cell death. Moreover, NAC and DPI treatment led to a decrease in ERK activity, and the ERK inhibitors PD98059 or U0126 enhanced the mdr1b-Luc activity of H-Ras^V12-NIH3T3 and reduced doxorubicin-induced apoptosis. These data suggest that Ras^V12 expression could downregulate mdr1b expression through intracellular reactive oxygen species (ROS) production, and ERK activation induced by ROS, is at least in part, contributed to the downregulation of mdr1b expression.

• BMB Reports
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• 제47권6호
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• pp.342-347
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• 2014

Histone acetylation/deacetylation has been known to be associated with the transcriptional regulation of various genes. The role of histone deacetylase-3 in the expression regulation of MDR1 was investigated. The expression level of HDAC3 showed an inverse relationship with the expression level of MDR1. Wild-type HDAC3, but not catalytic mutant $HDAC3^{S424A}$, negatively regulated the expression of MDR1. Wild-type HDAC3, but not catalytic mutant $HDAC3^{S424A}$, showed binding to the promoter sequences of HDAC3. HDAC3 regulated the expression level, and the binding of Ac-$H3^{K9/14}$ and Ac-$H4^{K16}$ around the MDR1 promoter sequences. The nuclear localization signal domain of HDAC3 was necessary, and sufficient for the binding of HDAC3 to the MDR1 promoter sequences and for conferring sensitivity to microtubule-targeting drugs.

• 한국자원식물학회지
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• 제22권3호
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• pp.273-280
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• 2009

A cDNA clone encoding a MDR-like ABC transporter protein was isolated from Brassica rapa seedlings, through rapid amplification of cDNA ends (RACE). This gene (named as Brmdr 1; GenBank accession no.: DQ296184 ) had a total length of 4222 bp with an open reading frame of 3900 bp, and encoded a predicted polypeptide of 1300 amino acids with a molecular weight of 143.1 kDa. The BrMDR1 protein shared 71.0, 62.5, 60.0 and 58.2% identity with other MDR proteins isolated from Arabidopsis thaliana (AAN28720), Coptis japonica (CjMDR), Gossypium hirsutum (GhMDR) and Triticum aestivum (TaMDR) at amino acid level, respectively. Southern blot analysis showed that Brmdr1 was a low-copy gene. Expression pattern analysis revealed that Brmdr1 constitutively expressed in the root, stem petals and stamens, but with lower expression in leaves and open flowers. The domains analysis showed that BrMDR1 protein possessed two transmembrane domains (TMDs) and two nucleotide binding domains (NBDs) arranging in "TMD1-NBD1-TMD2-NBD2" direction, which is consistent with other MDR transporters. Within NBDs three characteristic motifs common to all ABC transporters, "Walker A", "Walker B" and C motif, were found. These results indicate that BrMDR1 is a MDR-like ABC transporter protein that may be involved in the transport and accumulation of secondary metabolites.

• 정보처리학회논문지D
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• 제10D권2호
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• pp.247-260
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• 2003

한 도메인 내에서 다양한 데이터베이스의 데이터를 공유하고 표준화하기 위해 MDR(Metadata Registry)을 이용하여 정보를 통합할 수 있다. 그러나 MDR을 구축하는 조직간 데이터요소 표현의 불일치 때문에 MDR간 광역적인 정보를 통합하는데 어려움이 있다. 또한 웹과 같은 다양한 데이터베이스가 존재하는 환경에서 통합된 정보를 검색하고자 하는 사용자는 각각의 데이터베이스 스키마 정보를 확보하기엔 한계가 있다. 따라서 본 논문에서는 MDR과 온톨로지(Ontology)를 결합한 3계층 정보 통합 시스템을 제안한다. MDR간 데이터요소의 관계를 사상시키고 표현의 불일치를 해결하기 위해 MDR의 표준성기능과 온톨로지의 개념과 관계기능을 결합한 정보 통합 모델을 정의하고 에이전트 기술을 적용한 계층적이고 독립적인 정보 통합 아키텍처를 제안한다. 온톨로지는 사용자의 질의에서 개념을 추출하기 위한 의미망(semantic network)의 역할과 MDR간의 데이터요소 관계를 설정하기 위한 기능으로 적용되었다. MDR과 지식베이스(Knowledge Base)는 데이터요소간 표현 불일치를 해결하기 위해 적용하였다. 이러한 핵심요소를 고려하여 제안된 아키텍처를 사용하여 MDR과 온톨로지를 결합한 3계층 정보 통합 시스템을 구현하였다.

• Nuclear Medicine and Molecular Imaging
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• 제41권3호
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• pp.209-217
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• 2007

목적: mdr1유전자를 표적으로 한 short hairpin RNA (shMDR)는 다약재내성을 나타내는 암세포에서 효과적으로 mdr1 유전자의 발현을 억제 할 수 있고 sodium iodide symporter (NIS)는 유전자 치료와 리포터로의 기능을 동시에 나타낼 수 있다. 이 연구에서는 사람 대장암세포(HCT15)에 shMDR과 NIS를 동시에 이입하고 Tc-99m sestamibi와 I-125 섭취를 측정하였고 doxorubicin과 I-131 치료효과도 관찰하였다. 대상 및 방법: 사람 태아 신장 세포주(Human Embryonic Kidney cells; HEK293)에 liposome 시약으로 shMDR을 이입하고 RT-PCR과 western blot으로 분석하였다. shMDR와 NIS 유전자가 발현하는 adenovirus를 만들고 HCT15 세포에 이입 후 48시간에 shMDR에 의한 Pgp의 기능 억제를 확인하기위해 Tc-99m sestamibi 섭취와 doxorubicin 세포독성을 측정하였다. 또한 NIS유전자의 기능을 확인 하기위해 I-125 섭취와 I-131 세포독성도 확인하였다. 결과: shMDR이 이입 된 HEK293 세포에서 mdr1의 mRNA와 Pgp의 발현이 각각 75%, 80% 감소하였다. NIS 유전자가 발현하는 adenovirus를 HCT15 세포에 이입하고 NIS 유전자 발현을 확인 한 결과 대조군에 비해 월등히 높게 발현하였다. Ad-shMDR 300 MOI, Ad-shMDR 300 MOI 와 Ad-NIS 10 MOI를 처리한 경우 Tc-99m sestamibi의 섭취가 대조군보다 1.5배 정도 증가하였다. HCT15 세포에 Ad-NIS 10 MOI를 감염시킨 경우 I-125 섭취가 대조군에 비해 25배 이상 증가였다. 또한 Ad-shMDR와 Ad-NIS를 동시 감염 시켰을 경우 doxorubicin의 세포 독성이 증가하여 나타났고 Ad-NIS 20 MOI를 감염시켰을 때 I-131에 의한 세포독성이 대조군보다 증가하였다. 결론: 세포에 shMDR의 이입으로 mdr1 유전자의 발현이 억제되고 Tc-99m sestamibi의 섭취와 doxorubicin의 세포독성이 증가하였으며 NIS 유전자의 이입으로 I-125의 섭취와 I-131의 세포독성이 증가하였다. 다약제내성세포에 shMDR와 NIS 유전자의 동시 이입은 doxorubicin과 방사성 옥소의 이중치료 효과를 높일 수 있을 것으로 본다.

• 한국문헌정보학회지
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• 제54권3호
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• pp.263-283
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• 2020

이 연구는 ISO/IEC 11179 표준을 준수하는 메타데이터 레지스트리(MDR) 시스템의 재설계와 구현에 관한 것이다. 재설계의 핵심은 MDR 시스템을 유지하면서 이용자들에게 실제로 필요한 핵심이라 할 수 있는 클래스(class), 속성(property), 값 영역(vlaue domain)의 코드값을 중심으로 시스템을 재편하는 것에 있다. 이를 구현하기 위해서는 표준을 준수하는 운영 시스템이 필요하여, 그 대상을 한국정보통신기술협회의 MDR 시스템으로 하였다. 그 결과 재설계한 시스템은 표준에서 제시하고 있는 개념영역, 메타데이터 요소 개념, 메타데이터 요소, 값영역에 대한 이해 없이도 쉽게 특정 메타데이터의 검색과 활용이 가능함을 확인하였다.

• Archives of Pharmacal Research
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• 제19권3호
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• pp.213-218
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• 1996

Multidrug resistance (MDR) has been a major problem in cancer chemotherapy. To overcome this problem, we prepared minor ginsenosides stereoselectively from ginseng saponins and searched for a ginseng component which is effective for inhibition of MDR. MDR inhibition activity was determined by measuring cytotoxicity to MDR cells using multidrug resistant human fibrocarcinoma KB V20C, which is resistant to 20 nM vincristine and expresses high level of mdr1 gene. Of several ginseng components, 20(S)-ginsenoside Rg_3$, a red ginseng saponin, was found to have the most potent inhibitory activity on MDR and it's concentration capable of inhibiting 50% growth was $82\muM$.

• 정보처리학회논문지:소프트웨어 및 데이터공학
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• 제2권3호
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• pp.161-172
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• 2013

메타데이터 레지스트리(Metadata Registry, MDR)는 데이터베이스 간 데이터 교환 및 공유를 위해 ISO/IEC에서 개발한 국제 표준이며, 의료 서비스, 서지, 환경 등 다양한 도메인에서 데이터 공유 및 통합을 위해 사용되고 있다. 그러나 MDR 표준은 메타데이터 등록 및 저장을 위한 메타모델만을 정의하고 있기 때문에 이 시스템들은 서로 다른 물리적 구조를 가지게 된다. 이로 인해 MDR 시스템 간 불일치가 발생하고 메타데이터의 상호운용을 위해 추가적인 비용이 발생한다. 이러한 문제를 해결하기 위해 ISO/IEC 13249-8 Metadata Registry Access (MRA)가 개발 중에 있으며, MRA는 상이한 MDR 시스템에 일관된 방법으로 접근할 수 있는 표준 인터페이스이다. 그러나 MRA는 MDR 표준에 정의되어 있는 개념 즉, 클래스 간 관계성을 고려하지 않는다. 이는 부정확한 결과를 생성할 수 있으며, 각 MDR 시스템의 물리적 구조를 고려하여 질의를 모델링하고 재작성하는 추가적인 비용이 발생한다. 이 논문에서는 클래스 간 관계성을 고려한 확장된 인터페이스 eMRA(Extened MRA)를 제안하며, 비교 평가를 통해 확장 인터페이스의 장점을 기술한다. eMRA는 MDR의 개념간 관계성을 정의하여 질의 모델링과 시스템의 참조무결성 측면에서 MRA보다 우수한 성능을 가진다.

• Biomolecules & Therapeutics
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• 제19권2호
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• pp.174-180
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• 2011

Experiments were carried out to determine the role of Raf-1 kinase in the development of drug resistance to paclitaxel in v-H-ras transformed NIH 3T3 fibroblasts (Ras-NIH 3T3). We established a multidrug-resistant cell line (Ras-NIH 3T3/Mdr) from Ras-NIH 3T3 cells by stepwise increases in paclitaxel. Drug sensitivity assays indicated that the $IC_{50}$ value for drug-resistant Ras-NIH 3T3/Mdr cells was more than 1 ${\mu}M$ paclitaxel, 10- or more-fold higher than for the parental Ras-NIH 3T3 cells. Western blot and RT-PCR analysis showed that the drug efflux pump a P-glycoprotein were highly expressed in Ras-NIH 3T3/Mdr cells, while not being detectable in Ras-NIH 3T3 cells. Additionally, verapamil, which appears to inhibit drug efflux by acting as a substrate for P-glycoprotein, completely reversed resistance to paclitaxel in Ras-NIH 3T3/Mdr cell line, indicating that resistance to paclitaxel is associated with overexpression of the multidrug resistance gene. Interestingly, Ras-NIH 3T3/Mdr cells have higher basal Raf-1 activity compared to Ras-NIH 3T3 cells. Unexpectedly, however, the colocalization of Raf-1 and its negative regulator Spry2 was less observed in cytoplasm of Ras-NIH 3T3/Mdr cells due to translocation of Spry2 around the nucleus in the perinuclear zone, implying that Raf-1 may be released from negative feedback inhibition by interacting with Spry2. We also showed that shRNA-mediated knockdown of Raf-1 caused a moderate increase in cell susceptibility to paclitaxel. Thus, the results presented here suggest that a Raf-1-dependent pathway plays an important role in the development of acquired drug-resistance.