• 대한수의학회지
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• 제41권4호
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• pp.535-542
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• 2001

A multiplex PCR technique was developed for detecting specifically each Mycobacterium bovis, M. tuberculosis, M. avium and M. avium subsp, paratuberculosis, respectively, using clinical samples of field cattle. To apply this novel technique to clinical specimens, blood sample was obtained from live cows comprising 11 intradermal tuberculin test (ITT)-positive and 17 ITT-negative and tested by multiplex PCR. Positive results were obtained from 15 cows by the multiplex PCR, showing that 4 (23.5%) of the 17 ITT-negative cows were multiplex PCR positive. The multiplex PCR results also showed that among the 15 positive cows, 7 (46.7%) were infected with M. bovis, 1 (6.7%) with M. tuberculosis and 7 (46.7%) with M. avium. The sensitivity and specificity of multiplex PCR in comparison with those of ITT were 100% and 76.5%. The correlation between the multiplex PCR and ITT assays with blood samples was considered excellent, 85.7% agreement and ${\kappa}=0.72$. The results obtained, using reference mycobacterial strains and typed clinical samples, show that the multiplex PCR method may be a rapid, sensitive, and specific tool for the differential identification of various mycobacterial strains in a single-step assay. Therefore, multiplex PCR assay is a useful tool for early diagnosis of tuberculosis in live cattle and to identify the species or complex of mycobacterium from clinical samples.

• 한국식품위생안전성학회지
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• 제36권4호
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• pp.289-297
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• 2021

본 연구에서 multiplex PCR과 real-time PCR을 이용하여 창난젓의 원료를 감별할 수 있는 새로운 판별법을 개발하였다. 명태와 가이양의 종 특이 프라이머를 디자인하고, 명태와 가이양의 genomic DNA를 template로 single PCR과 multiplex PCR을 실시하였다. PCR을 실시한 결과, single PCR에서 명태(297 bp)와 가이양(132 bp)에 해당하는 PCR 밴드를 확인하였으며 교차 반응이 일어나지 않는 것을 확인하였다. Multiplex PCR에서 명태와 가이양 사이에 교차반응 없이 증폭이 일어나는 것을 확인하였다. Real-time PCR 결과, 명태 종 판별 프라이머에서 명태의 Ct 평균값은 20.765±0.691, 가이양 시료에서 Ct 평균값은 35.719±1.828이었으며, 가이양 종 판별 프라이머에서 명태 시료의 Ct 평균값은 35.996±1.423, 가이양 시료의 Ct 평균값은 20.096±0.793으로 프라이머의 효율성, 특이성 및 교차 반응성에서 유의한 차이가 나타났다. 이러한 결과를 바탕으로 시중에서 판매되는 7개 제품을 multiplex PCR 및 real-time PCR로 확인하였으며, 모든 시료에서 유효한 결과를 확인하였다. 본 연구에서 제작된 명태와 가이양에 대한 종 특이적 프라이머는 가공된 젓갈 시료의 원료의 판별 가능하며, 이러한 결과는 식품안전관리에 기여할 수 있을 것으로 기대된다.

• 현장농수산연구지
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• 제5권1호
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• pp.57-63
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• 2003

The bovine rotavirus(BRV), bovine coronavirus(BCV) and bovine viral diarrhea virus(BVDV) are main viruses of bovine viral diarrhea disease. These viruses could be rapidly amplified by the reverse transcriptase polymerase chain reaction(RT-PCR). This study was conducted to develop rapid and accurate diagnostic methods of these viral diseases by multiplex RT-PCR. Specific primers were designed based on the sequences reported by Chang KO et. al. (1997) and Schroeder BA, et. al. (1990), RNA were prepared from the cultured viruses, first-stranded DNAs were synthesised by reverse transcriptase. PCR were conducted to amplify specific regions of the viruses by multiplex. Three bands such as 1,062bp for BRV, 458bp for BCV, and 300bp for BVDV were successfully produced by multiplex RT-PCR. In conclusion, this result suggested that these viruses could be diagnosed rapidly and accurately by multiplex RT-PCR.

• 한국축산식품학회지
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• 제34권5호
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• pp.717-723
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• 2014

A rapid and specific PCR assay for the simultaneous detection of Listeria monocytogenes, Escherichia coli O157:H7, Bacillus cereus, Salmonella spp., and Staphylococcus aureus in foods was developed to reduce the detection time and to increase sensitivity. Multiplex PCR developed in this study produced only actA, fliC, hbl, invA, ileS amplicons, but did not produce any non-specific amplicon. The primer sets successfully amplified the target genes in the multiplex PCR without any non-specific or additional bands on the other strains. The multiplex PCR assays also amplified some target genes from five pathogens, and multiplex amplification was obtained from as little as 1 pg of DNA. According to the results from the sensitivity evaluation, the multiplex PCR developed in this study detected 10 cells/mL of the pathogens inoculated in milk samples, respectively. The results suggested that multiplex PCR was an effective assay demonstrating high specificity for the simultaneous detection of five target pathogens in food system.

• 대한수의학회지
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• 제43권2호
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• pp.231-237
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• 2003

Listeria (L.) monocytogenes in samples could not be detected occasioally by faster growth of other Listeria spp. especially L. innocua. The aim of this study was to develop the differential media and multiplex polymerase chain reaction (PCR) assays for the rapid detection of L. monocytogenes. L. monocytogenes colonies were characterized by their ${\beta}$-hemolysis with fluorescence under 366 nm UV light on the Listeria hemolysis agar (LHA). L. innocua, a species commonly present in foods, did not produce ${\beta}$-hemolysis on LHA. Therefore, one or more colonies of L. monocytogenes were easily distinguished from large populations of L. innocua. The multiplex PCR assays were developed to distinguish from L. monocytogenes and other Listeria spp. with two pairs of primers. The primers were designed in 16S rRNA and listeriolysin O gene for specific amplification of all members of the genus Listeria and L. monocytogenes, respectively. The multiplex PCR assays produced 560 and 938 bp products in L. monocytogenes; only 938 bp products in the genus Listeria. The multiplex PCR assays could detect as little as 50 pg of L monocytogenes DNA. These results indicated that the differential media and multiplex PCR assays might be useful diagnostic tools for the rapid detection of L. monocytogenes.

• 치위생과학회지
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• 제9권2호
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• pp.249-255
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• 2009

본 연구는 성인성 치주염 환자의 치은연하 치면세균막을 총 60개 치아에서 채취하여 F. nucleatum과 A. actinomycetemcomitans의 동정을 위해 세균배양법, single PCR법 및 mutliplex PCR법을 실시하였고, 세균 동정법간의 비교를 통해 다음과 같은 결과를 얻었다. 1. F. nucleatum과 A. actinomycetemcomitans의 동정을 위해 세균배양법, single PCR 및 multiplex PCR을 실시한 결과 F. nucleatum은 각각 12개(20.0%), 45개(75.0%), 43개(71.7%) 치아에서 양성반응을 보였지만, A. actinomycetemcomitans는 각각 0개(0.0%), 4개(6.7%), 1개(1.7%) 치아에서 양성반응이 나타났다. 2. F. nucleatum은 세균배양법에 비해 single PCR법 및 multiplex PCR법에서 높은 검출 빈도를 보여 좀 더 효율적인 세균 동정법으로 생각되었지만, 통계적으로는 유의한 차이가 없었다. 3. A. actinomycetemcomitans는 세균배양법에서 전혀 검출되지 않아 통계적으로 검정할 수 없었고, 세균 동정법간의 비교도 어려웠다. 4. F. nucleatum과 A. actinomycetemcomitans의 동정을 위한 single PCR법과 multiplex PCR법 간의 비교에서 두 세균 모두 검출 빈도에 있어서는 큰 차이를 보이지 않았지만, 통계적으로는 유의한 차이를 보였다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제26권12호
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• pp.2199-2205
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• 2016

Vibrio cholerae O1 serogroup Wave 3 El Tor strains are presently prevalent worldwide. The Wave 3 El Tor strains contain a TLC:RS1:CTX array on chromosome 1, and no element is integrated on chromosome 2. A multiplex PCR optimized to identify the TLC:RS1:CTX array of Wave 3 strains has been developed in this study. By using eight primers, the multiplex PCR can identify the characteristic CTX and RS1 array of Wave 3 strains from various arrays of strains belonging to other Waves. The four amplified DNA fragments of Wave 3 strains have been cloned in a vector, which could be used as a positive control for the multiplex PCR. This multiplex PCR and the positive control set could be useful tools for rapid recognition of Wave 3 El Tor strains.

• 한국임상수의학회지
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• 제25권4호
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• pp.241-244
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• 2008

본 연구는 특이적인 임상증상이 없는 360두의 개를 대상으로 multiplex nested PCR 기법을 이용하여 Brucella spp. 및 Leptospira interrogans를 검출하였다. Brucella spp.는 총4두 (1.1%, 암컷 2두, 수컷 2두)가 검출되었고, Leptospira interrogans는 59두 (16.4%, 암컷31두, 수컷28두)에서 검출되었다. 결론적으로 Brucella spp.의 검출률은 낮은 반면 Leptospira interrogans는 높았다. 또한 multiplex nested PCR기법은 무증상의 개 혈액에서 Brucella spp. 및 Leptospira interrogans를 조기에 검출하는데 빠르고 편리한 기법으로 판단된다.

• 미생물학회지
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• 제49권3호
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• pp.292-296
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• 2013

본 연구는 multiplex real-time PCR을 이용하여 Actinobacillus actinomycetemcomitans, Campylobacter rectus, Porphyromonas gingivalis, Tannerella forsythus, Treponema denticola, Prevotella intermedia 등과 같은 6종의 주요 치주 질환 원인 미생물들을 동시에 검출할 수 있는 분석 방법에 관한 것이다. 4개의 형광 염료를 사용하여 internal control과 함께 3개의 균종씩 나누어 분석하였으며, 분석 대상 균종 간 그리고 다른 종류의 구강 미생물 균종과의 간섭과 교차 반응이 없음을 확인하였다. 본 연구의 multiplex real-time PCR은 타액과 플라그 등의 다양한 샘플에 포함되어 있는 각 미생물들을 정성, 정량적으로 분석할 수 있었으며, 치주염 환자와 건강한 사람들에 대한 비교 분석 결과 분명한 차이를 발견 할 수 있었다.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제40권4호
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• pp.339-347
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• 2012

동물세포배양 유래 생물의약품 생산 공정에서 다양한 외래성 바이러스가 오염된 사례가 있기 때문에 바이러스 안전성 보증을 위한 바이러스 검출시험이 필수적이다. Reovirus (Reo), bovine viral diarrhea virus (BVDV), bovine parainfluenza virus (BPIV)는 동물 세포주와 동물 세포 배양 공정에 오염되는 대표적인 RNA 바이러스이다. 세포배양 유래 생물의약품의 안전성을 확보하기 위해, 세포주, 원료물질, 제조공정, 완제품에서 Reo, BVDV, BPIV를 동시에 검출할 수 있는 Multiplex Reverse Transcription (RT)-PCR 시험법을 확립하였다. Reo, BVDV, BPIV에 특이적인 primer를 선별하였으며, multiplex RT-PCR 시험법을 최적화하였다. Reo, BVDV, BPIV를 동시에 검출할 수 있는 multiplex RT-PCR 시험법의 민감도는 각각 $7.76{\times}10^2\;TCID_{50}/ml$, $7.44{\times}10^1\;TCID_{50}/ml$, $6.75{\times}10^1\;TCID_{50}/ml$이었다. 확립된 multiplex RT-PCR을 생물의약품 제조공정 검증에 적용할 수 있는지 확인하기 위하여 인위적으로 각 바이러스를 오염시킨 CHO 세포에서 검출 시험을 실시한 결과 각 바이러스를 감염시킨 CHO 세포와 세포배양 상청액에서 각 바이러스를 검출할 수 있었다. 위와 같은 결과에서 확립된 multiplex RT-PCR시험법은 세포주, 원료물질, 제조공정, 완제품에서 Reo, BVDV, BPIV를 동시에 검출할 수 있는 특이성과 민감성이 우수한 시험법임을 확인하였다.